W perspektywie finansowej 2021-2027, Centrum Projektów Europejskich pełni rolę Kontrolera Krajowego (KK) dla programów:

• Interreg Region Morza Bałtyckiego 2021-2027
• Interreg Europa Środkowa 2021-2027
• Interreg Europa 2021-2027
• URBACT IV
• Interreg NEXT Polska-Ukraina 2021-2027 (dla województwa mazowieckiego i lubelskiego)

System kontroli jest scentralizowany i bezpłatny dla polskich partnerów ww. programów.

Realizacja zadań kontrolera ma na celu między innymi weryfikację raportów/wniosków o płatność (WoP) oraz wystawienie certyfikatu dla wydatków potwierdzającego, że:

• projekt jest realizowany zgodnie z mającym zastosowanie prawem unijnym i krajowym oraz programowymi zasadami kwalifikowalności oraz, że wydatki są zgodne z warunkami wsparcia projektu
• dofinansowane działania zostały realizowane i zapłacone.